Der ganze Aufwand wäre einfach überflüssig... Brenn den Film auf DVD und verfüttere das Ding an Deinen Standalone-DVD-Player. Sowohl dort als auch am Fernseher selber lässt sich das Bildformat umschalten.

Edit: Wenn Du den Film trotzdem unbedingt ins richtige Format kodieren willst, nimm AVIdemux . File öffnen, Video-Codec richtig einstellen (MPEG4-ASP), unter Configure => User Interface => Encoding Mode die beste Kodierungsmethode einstellen (Two Pass - Videogröße), zusätzlich unter Zielgröße diese etwas größer als das Ausgangsmaterial einstellen. Mit OK beenden.
Die Formatumstellung erfolgt unter Filters => Transform => Resize. Das grüne "+" unten anklicken, im sich öffnenden Fenster unter "Aspect Ratio erstmal den Haken unter "Lock" entfernen und bei "Destination" dann 16:9 einstellen. Unter "Resize Dimensions" kannst unter "Wide" noch 640 einstellen unter unter "Height" dann 360 (macht 16:9, simpler Dreisatz). Ich weiß allerdings nicht ob das nötig ist, habe diese Prozedur bislang noch nicht durchgeführt. Kann also auch sein dass das Programm selber sinvolle Werte einträgt, dann eben nichts ändern. Wieder mit o.k. beenden, dann auf das Diskettensymbol klicken (für Speichern), einen Namen eingeben (Wichtig: Mit Dateinamenerweiterung, also *.avi, AVIdemux macht das nicht selber) und den Vorgang losrennen lassen. Dass das File dabei völlig neu kodiert wird ist klar, kann also ein Weilchen (Sprich ein paar Stunden, je nachdem wie schnell Dein Rechner ist) dauern.

Nochmals Edit: Das Programm AVIdemux gehört eigentlich auf jeden Rechner. Das Programm stammt zwar aus der Linux-Welt, gibt es aber auch für Windows (momentan dort aber leider nur 32bit). AVIdemux kann - anders als VDubMod oder NanDub - per default auch Untertitel ohne Zusatzprogramme einbrennen, kommt dabei mit .srt und den innerhalb der Scene üblichen .sub/.idx out-of-the-Box klar.